Kirkkomusiikin ja urkujen aineryhmässä voi opiskella pääaineenaan joko kirkkomusiikkiopintoja tai solistisia urkujen tai klavikordin instrumenttiopintoja. Kirkkomusiikin opiskelija voi valita suuntautumisvaihtoehdokseen joko evankelis-luterilaisen suuntautumisvaihtoehdon (sekä Helsingissä että Kuopiossa) tai yleisen suuntautumisvaihtoehdon (vain Kuopiossa). Evankelis-luterilaisen suuntautumisvaihtoehdon mukaisesti suoritettu musiikin maisterin tutkinto on Suomen evankelis-luterilaisen kirkon piispainkokouksen päätöksen mukaan ylempi korkeakoulututkinto, joka edellytetään useimpiin kyseisen kirkon kanttorinvirkoihin hakevalta. Yleisen suuntautumisvaihtoehdon mukaan suoritetut opinnot eivät anna kelpoisuutta Suomen evankelisluterilaisen kirkon kanttorinvirkoihin, mutta ne antavat valmiuksia esimerkiksi muiden kirkkojen ja kristillisten yhteisöjen tehtäviin. Molemmissa voi suorittaa musiikin kandidaatin (180 op) ja musiikin maisterin (150 op) tutkinnot. Vuosittain opintonsa aloittaa 25-30 uutta kirkkomusiikin opiskelijaa ja muutamia urkujensoiton opiskelijoita. Musiikin kandidaatin opinnot kestävät noin kolme vuotta ja sen jälkeiset maisteriopinnot 2,5 vuotta.
Musiikin kandidaatti (180 op) Pääaine kirkkomusiikki | Musiikin maisteri (150 op) Pääaine kirkkomusiikki |
Musiikin kandidaatti (180 op) Pääaineen instrumenttiopinnot (urut tai klavikordi) | Musiikin maisteri (150 op)Pääaineen instrumenttiopinnot (urut tai klavikordi)Urkumusiikin erityisopinnot Tiedonhankinnan sekä kirjallisen ilmaisun opinnot Opinnäyte ja kypsyysnäyte Valinnaiset opinnot |

